MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp25

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008569	TA	3	6	451	456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008569	TTC	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008569	ATTG	2	8	473	480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008569	TACT	2	8	505	512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008569	GTA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008569	ATA	2	6	542	547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008569	ATA	2	6	570	575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008569	ATAG	2	8	632	639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008569	ATTT	2	8	640	647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008569	A	6	6	666	671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008569	GTA	2	6	1274	1279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008569	ATA	2	6	1299	1304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008569	T	7	7	3392	3398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008569	GAA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008569	CCT	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008569	CCA	2	6	3458	3463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008569	CCT	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008569	ACC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008569	ATC	2	6	5315	5320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008569	T	6	6	5360	5365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008569	TCCTC	2	10	5397	5406	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_008569	T	7	7	5435	5441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008569	AGA	2	6	5446	5451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008569	A	7	7	5456	5462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008569	T	8	8	5465	5472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008569	CTA	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008569	TAC	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008569	CAGC	2	8	5540	5547	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008569	T	7	7	5612	5618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008569	A	6	6	5642	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008569	GGA	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008569	AT	3	6	10376	10381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008569	TAA	2	6	10723	10728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008569	A	9	9	12850	12858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008569	AGA	2	6	15480	15485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008569	AAT	2	6	16141	16146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008569	TTAG	2	8	16189	16196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008569	A	7	7	16247	16253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008569	A	6	6	16258	16263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008569	T	6	6	16289	16294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008569	TAT	2	6	16329	16334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008569	TCT	2	6	16391	16396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008569	TTAA	2	8	16459	16466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008569	TAT	2	6	16474	16479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008569	A	8	8	17089	17096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008569	A	8	8	17107	17114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008569	TAT	2	6	17116	17121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008569	GTA	2	6	17192	17197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008569	T	7	7	18513	18519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008569	TA	3	6	18548	18553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008569	T	6	6	18562	18567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008569	AGG	2	6	18570	18575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008569	TTG	2	6	19239	19244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008569	CAA	2	6	19269	19274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008569	TAG	2	6	19283	19288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008569	ATTA	2	8	19857	19864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008569	CCT	2	6	20422	20427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008569	AAT	2	6	20428	20433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008569	GGAT	2	8	20476	20483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008569	T	7	7	20492	20498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008569	ATG	2	6	20507	20512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008569	T	10	10	20514	20523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008569	ACA	2	6	20524	20529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008569	CCT	2	6	24358	24363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008569	AAT	2	6	24364	24369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008569	T	6	6	24426	24431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008569	AT	3	6	24506	24511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008569	TA	3	6	24586	24591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008569	TA	3	6	24630	24635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008569	TGGT	2	8	24645	24652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008569	ATA	3	9	24659	24667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008569	GTT	2	6	24681	24686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008569	T	7	7	24721	24727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008569	CAC	2	6	24738	24743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.